庆39中始建于1955年，50多年来，学校先后“三次”被评为重庆市“先进学校”。1962年，在首次初中毕业会考中，39中列全市第5名，1980年被评为重庆市“先进电教化学校”。

学校是全国“德育先进实验学校”；重庆市“安全文明校园”；南岸区“示范级初中”；南岸区及南岸区教育系统“先进基层党组织”；南岸区首批“科技活动示范校”；南岸区“文明单位标兵”；南岸区“家长学校示范校”……

学校先后整合了重庆123中，重庆4中分流人员，重庆91中等校师资。

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学校总占地21160平方米，建筑总面积13100平方米，为花园式园林学校。学校有一支高素质的教师队伍和管理队伍，高中级教师占66%以上，形成由中学高级教师、市、区、校骨干教师等构成的完善的教师队伍。学生1000人余人，教职工91人。

近年来，学校教育教学质量稳步提升，其中初2011级联招上线比上一年增长8.5%，希望就读39中学学生每年以35%的比例增长。

近两年教师参加赛课、科技活动、论文评选等各类奖励获国家级奖10人次，市级奖30人次，区级奖69人次。

学校以“三九互助会”和“古道仰止社”为文化载体，形成“诗韵三九 和谐自强”的文化特色。将诗歌教育、“2+2”活动与校本课程开发相结合，开设了田径、篮球、绳操、合唱团、舞蹈队、吉他、版画以及机器人、科技制作等活动课程。两年来，学生获国家级奖10余人次，市级奖 52人次，区级奖138人次。……